W związku z wejściem w życie reformy oświatowej, Uchwałą Rady Gminy z dnia 4 marca 1999 r. utworzono Gimnazjum w Baruchowie.
1 września 1999 r. w nowo  powołanej placówce rozpoczęło naukę 66 uczniów, a pracę - 12 nauczycieli wraz z dyrektorem Włodzimierzem Majewskim.
Gimnazjum miało swoją siedzibę w budynku szkoły podstawowej. W czasie wakacji w 2000 r. obiekt ten przeżył kapitalny remont, dzięki czemu stworzono uczniom dogodniejsze warunki do pracy. Mimo dużego nakładu finansowego poniesionego na remont budynku, był on za mały, aby pomieścić dwie szkoły. Zarówno władze gminy jak i dyrektor gimnazjum zdawali sobie sprawę z potrzeby budowy nowego obiektu. W październiku 2000 r. wójt gminy, pan Stanisław Sadowski, przedstawił projekt rozbudowy szkoły. Wkrótce odbył się przetarg, który wygrała firma budowlana „Z.B. Waldemar Boś” z Włocławka. W marcu 2001 r. przygotowano teren pod fundamenty nowego budynku gimnazjum. W szybkim tempie „rosły” mury gimnazjum.

 

 

11 lipca 2001 r. pierwszy konkurs na stanowisko dyrektora gimnazjum wygrał jednogłośnie pan Włodzimierz Majewski.
W roku szkolnym 2001/2002 szkoła liczyła 188 uczniów. Wprowadzono nowe zajęcia WdŻwR, a od września 2002 r. - zgodnie z życzeniem rodziców - drugi język obcy (j. niemiecki) i ekologię. Uczniowie mogli także uczestniczyć w zajęciach: kółka tanecznego, informatycznego i SKS.
Praca w gimnazjum nie jest łatwa dlatego też bardzo cenną okazuje się wszelka pomoc, przede wszystkim rodziców naszych uczniów. Pomagają nam w codziennych kłopotach ci rodzice, którym zależy na sukcesach dzieci. Angażują się w pracę szkoły, sponsorują różne imprezy, kupują nagrody i upominki, organizują bale sylwestrowe i karnawałowe, a dochody z nich przeznaczają na potrzeby placówki. Rada Rodziców, m.in. uczestniczyła w znacznym stopniu w ufundowania sztandaru naszego gimnazjum.

 

 

25 sierpnia 2002 r. gimnazjum otrzymało imię Marii Kretkowskiej, a rodzice przekazali uczniom sztandar. Społeczność szkolna wybrała na patronkę szkoły Marię Kretkowską - wybitną działaczkę społeczną, organizatorkę ochronek i tajnego nauczania, kobietę o wyjątkowych walorach moralnych, ostatnią dziedziczkę dóbr baruchowskich. Tegoż dnia został również poświęcony i oddany do użytku nowy budynek szkoły. Przestronne pomieszczenia wyposażone w sprzęt i pomoce dydaktyczne służące w pełni właściwemu poziomowi procesu nauczania, a także właściwie przygotowana kadra nauczycielska sprzyjają przyswajaniu wiedzy i rozwijaniu talentów uczącej się tu młodzieży.